Fluctuations dans les lignées et colonies de cellules
Nous étudions les propriétés universelles des systèmes biologiques modélisés par des arbres branchants. En nous basant sur deux échantillonages différents des lignées d'un arbre, nous obtenons un ensemble de contraintes sur la croissance de l'arbre, le nombre moyen de divisions le long des lignées et la force de sélection. Cela permet de quantifier le biais statistique entre les données obtenues au niveau de la lignée unique et à l'échelle de la population. Ces résultats sont interprétés dans le cadre de la thermodynamique stochastique et de la théorie de la réponse linéaire, et sont universels au sens où ils reposent uniquement sur la structure branchante de l'arbre et non sur la dynamique qui génère celui-ci. Bien que notre recherche soit formulée dans le contexte des colonies de cellules, elle s'applique à tout processus de branchement, tels que les arbres phylogénétiques en évolution.
Publications associées :
- Analytical cell size distribution: lineage-population bias and parameter inference, A. Genthon, Journal of the Royal Society Interface 19, 20220405 (2022) [arXiv, journal]
- Universal constraints on selection strength in lineage trees, A. Genthon, D. Lacoste, Physical Review Research 3, 023187 (2021) [journal (OA)]
- Fluctuation relations and fitness landscapes of growing cell populations, A. Genthon, D. Lacoste, Scientific Reports 10, 11889 (2020) [journal (OA)]
- Linking lineage and population observables in biological branching processes, R. Garcia-Garcia, A. Genthon, D. Lacoste, Physical Review E 99, 042413 (2019) [arXiv, journal]